Le ministère chargé de la santé et la Haute autorité de santé mettent en œuvre un recueil d’indicateurs de qualité des soins dans les établissements de santé, publics comme privés. L'agence développe et héberge les plateformes de recueil de ces informations, gère les données recueillies, calcule les indicateurs et les restitue. L'ATIH assure également le support technique aux utilisateurs.

Bilan standardisé de lutte contre les infections nosocomiales (Bilanlin)

En application de l'article R. 6111-8 du code de la santé publique, les établissements de santé remplissent annuellement le bilan défini par l’arrêté du 7 avril 2011 modifié relatif au bilan annuel des activités de lutte contre les infections nosocomiales dans les établissements de santé (TBIN).
Cette instruction et ses annexes définissent les modalités pratiques de recueil du bilan et mettent à disposition le cahier des charges et la pondération des items des indicateurs du tableau de bord des infections nosocomiales calculés à partir de ce recueil. Les déclarations du bilan standardisé des établissements de santé s'effectuent sur le site internet sécurisé  « Bilanlin » accessible par le lien suivant : http://bilanlin.atih.sante.fr